Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.8 ms