Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYCP1Q15431 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms