Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LAPTM4AQ15012 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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