Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL4A6Q14031 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms