Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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CBFBQ13951 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBFBQ13951 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
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