Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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