Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 TSN-202ENST00000409193 1436 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 AC008033.3-201ENST00000612531 1407 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 UBE2D3-202ENST00000338145 896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 PGGT1BP1-201ENST00000455321 1023 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 Metazoa_SRP.125-201ENST00000618659 283 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 TMEM138-202ENST00000381787 1205 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 AC110015.1-201ENST00000423367 440 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 RPS3AP29-201ENST00000437728 769 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 SEPHS1P7-201ENST00000452995 1177 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CAMK2BQ13554 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms