RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.59■■■□□ 2.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.72■■□□□ 1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADRA2BP18089 450 aa22.11■■□□□ 1.13
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.88■■□□□ 1.09
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FOXD1Q16676 465 aa21.86■■□□□ 1.09
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNA4P22459 653 aa21.77■■□□□ 1.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.59■■□□□ 1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.02■□□□□ 0.96
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.85■□□□□ 0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.21■□□□□ 0.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZBTB22O15209 634 aa20.05■□□□□ 0.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.81■□□□□ 0.76
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MSH5O43196 834 aa19.76■□□□□ 0.75
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FOXD4L1Q9NU39 408 aa19.75■□□□□ 0.75
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NISCHQ9Y2I1 1504 aa19.61■□□□□ 0.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DMRT2Q9Y5R5 561 aa19.12■□□□□ 0.65
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC4A2P04920 1241 aa19.06■□□□□ 0.64
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC24A1O60721 1099 aa19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATXN8OSP0DMR3 200 aa19■□□□□ 0.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FKBP8Q14318 412 aa18.78■□□□□ 0.6
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.24■□□□□ 0.51
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DCAF8L1A6NGE4 600 aa18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FBXO3Q9UK99 471 aa17.87■□□□□ 0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 APLP2Q06481 763 aa17.84■□□□□ 0.45
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POTEDQ86YR6 584 aa17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPDYE4A6NLX3 237 aa17.72■□□□□ 0.43
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PROM2Q8N271 834 aa17.63■□□□□ 0.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLCB2Q00722 1185 aa17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VASPP50552 380 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FBLN2P98095 1184 aa17.5■□□□□ 0.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa17.33■□□□□ 0.37
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DCAF8L2P0C7V8 631 aa17.31■□□□□ 0.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POLA2Q14181 598 aa17.26■□□□□ 0.35
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PKD2Q13563 968 aa17.24■□□□□ 0.35
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BCANQ96GW7 911 aa17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VSIG10Q8N0Z9 540 aa17.12■□□□□ 0.33
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CAPN15O75808 1086 aa17.1■□□□□ 0.33
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ABCC9O60706 1549 aa17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPOCK2Q92563 424 aa17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF39Q9H2S5 420 aa17.02■□□□□ 0.32
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLHL34Q8N239 644 aa16.99■□□□□ 0.31
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TAOK2Q9UL54 1235 aa16.88■□□□□ 0.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ABCB7O75027 752 aa16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.82■□□□□ 0.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLCD3Q8N3E9 789 aa16.79■□□□□ 0.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa16.79■□□□□ 0.28
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CFAP44Q96MT7 982 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPDYE2BA6NHP3 402 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPDYE6P0CI01 402 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RGL2O15211 777 aa16.72■□□□□ 0.27
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SSUH2Q9Y2M2 353 aa16.72■□□□□ 0.27
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MIER1Q8N108 512 aa16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OSCARQ8IYS5 282 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.62■□□□□ 0.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TPRNQ4KMQ1 711 aa16.6■□□□□ 0.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DSG3P32926 999 aa16.57■□□□□ 0.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLEKHG5O94827 1062 aa16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.55■□□□□ 0.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHGAP10645 457 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIM41Q8WV44 630 aa16.51■□□□□ 0.23
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HS6ST3Q8IZP7 471 aa16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.39■□□□□ 0.21
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