Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK3Q13003 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms