Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FPGSQ05932 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms