Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARDQ03181 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms