Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTBN1Q01082 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms