Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF9Q00978 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms