Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFAMQ00059 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms