Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms