Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DAP3P51398 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms