Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms