Protein–RNA interactions for Protein: P41970

ELK3, ETS domain-containing protein Elk-3, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK3P41970 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELK3P41970 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ELK3P41970 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELK3P41970 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELK3P41970 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELK3P41970 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELK3P41970 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELK3P41970 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELK3P41970 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELK3P41970 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELK3P41970 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELK3P41970 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELK3P41970 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELK3P41970 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms