Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms