Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB5P28074 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms