Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1P23471 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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