Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XPAP23025 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XPAP23025 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XPAP23025 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms