Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms