Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDPSP14324 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDPSP14324 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDPSP14324 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDPSP14324 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDPSP14324 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDPSP14324 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDPSP14324 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDPSP14324 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDPSP14324 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDPSP14324 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDPSP14324 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDPSP14324 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDPSP14324 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDPSP14324 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDPSP14324 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDPSP14324 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDPSP14324 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDPSP14324 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDPSP14324 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDPSP14324 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDPSP14324 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDPSP14324 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDPSP14324 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FDPSP14324 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FDPSP14324 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FDPSP14324 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
FDPSP14324 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FDPSP14324 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FDPSP14324 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FDPSP14324 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDPSP14324 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDPSP14324 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDPSP14324 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDPSP14324 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDPSP14324 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FDPSP14324 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDPSP14324 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDPSP14324 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDPSP14324 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDPSP14324 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDPSP14324 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FDPSP14324 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms