Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHGAP10645 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHGAP10645 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHGAP10645 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHGAP10645 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHGAP10645 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHGAP10645 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHGAP10645 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHGAP10645 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHGAP10645 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHGAP10645 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHGAP10645 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHGAP10645 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHGAP10645 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHGAP10645 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHGAP10645 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHGAP10645 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHGAP10645 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHGAP10645 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHGAP10645 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHGAP10645 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHGAP10645 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHGAP10645 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHGAP10645 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHGAP10645 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHGAP10645 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHGAP10645 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHGAP10645 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHGAP10645 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHGAP10645 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHGAP10645 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHGAP10645 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHGAP10645 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHGAP10645 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHGAP10645 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHGAP10645 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms