Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLI2P10070 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI2P10070 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI2P10070 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI2P10070 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI2P10070 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI2P10070 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI2P10070 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI2P10070 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI2P10070 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI2P10070 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI2P10070 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI2P10070 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI2P10070 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI2P10070 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI2P10070 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI2P10070 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI2P10070 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLI2P10070 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI2P10070 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI2P10070 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI2P10070 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI2P10070 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI2P10070 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI2P10070 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI2P10070 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI2P10070 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI2P10070 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI2P10070 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI2P10070 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI2P10070 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI2P10070 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI2P10070 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLI2P10070 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI2P10070 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI2P10070 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI2P10070 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI2P10070 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI2P10070 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI2P10070 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI2P10070 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI2P10070 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI2P10070 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI2P10070 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI2P10070 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI2P10070 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI2P10070 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLI2P10070 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLI2P10070 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI2P10070 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI2P10070 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI2P10070 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI2P10070 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI2P10070 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI2P10070 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI2P10070 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI2P10070 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI2P10070 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI2P10070 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLI2P10070 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms