Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LDLRP01130 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LDLRP01130 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LDLRP01130 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LDLRP01130 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LDLRP01130 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LDLRP01130 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LDLRP01130 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LDLRP01130 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LDLRP01130 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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