Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIOO75962 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIOO75962 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIOO75962 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIOO75962 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIOO75962 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIOO75962 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIOO75962 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIOO75962 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIOO75962 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIOO75962 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIOO75962 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIOO75962 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIOO75962 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIOO75962 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIOO75962 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIOO75962 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIOO75962 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIOO75962 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIOO75962 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIOO75962 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIOO75962 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIOO75962 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIOO75962 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRIOO75962 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIOO75962 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIOO75962 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIOO75962 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIOO75962 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRIOO75962 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIOO75962 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIOO75962 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIOO75962 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRIOO75962 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRIOO75962 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms