Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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SEC22BO75396 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SEC22BO75396 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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SEC22BO75396 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SEC22BO75396 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SEC22BO75396 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SEC22BO75396 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEC22BO75396 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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