Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPAG9O60271 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAG9O60271 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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