Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PACSIN2Q9UNF0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PACSIN2Q9UNF0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms