Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.9 ms