Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms