Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APEX2Q9UBZ4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms