Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS1Q9NYS0 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms