Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIRIP3Q9BW71 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms