Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPAN18Q96SJ8 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms