Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP8

GBP5, Guanylate-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP5Q96PP8 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP5Q96PP8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 380.2 ms