Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms