Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RNFT2Q96EX2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms