Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN23Q96B33 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLDN23Q96B33 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms