Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM35BQ8NCS4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms