Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AMER3Q8N944 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms