Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFRP1Q8N474 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms