Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ52

CHPF, Chondroitin sulfate synthase 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPFQ8IZ52 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHPFQ8IZ52 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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