Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms