Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms