Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP28Q4G0W2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms