Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms