Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCK2Q16822 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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